​
במגמת מחשבת ישראל שבבית החינוך "נופי הבשור" מתקיימים שלושה דגמים של עבודות חקר:
 
1.  פורטפוליו כיתתי/אישי
בפסח של שנת י"א התלמידים  בוחרים  את נושא הלימוד לכיתה י"ב. מתחילת שנה"ל עד פורים י"ב התלמידים  לומדים את הנושא בדרך של עבודות חקר קטנות, רפרטים בפני הכיתה וצבירת כל החומרים בפורטפוליו. בין פורים לפסח כל תלמיד  כותב עבודת חקר אישית בהיקף של 10 עמודים ומציג אותה בפני הכיתה (בדרך כלל בנוכחות רכזת ההוראה או מנהלת ביה"ס).
 
להלן הנושאים שנבחרו על-ידי התלמידים כנושא לימוד לכיתה י"ב:
תשע"ב: אמונה ומשבר האמונה
תשע"א: גוף ונפש
תש"ע:   יהדות ודמוקרטיה
תשס"ט: שלוש הדתות המונותיאיסטיות
תשס"ח: גזירה קדומה וחופש הבחירה
 
2.      עבודות חקר בהיקף של 2 יח"ל
לתלמידים ניתנת האפשרות לכתוב עבודת חקר בהיקף של 2 יח"ל. תלמידים אלה לא משתתפים בשעורים של הכיתה, אלא נפגשים פעם בשבוע/שבועיים עם המורה לקידום עבודת החקר האישית.
להלן מספר דוגמאות של עבודות חקר אישיות:
צליל מלכה:              שורשים תורניים לאידיולוגיה של כהנא
ורד לב:                   קנאות במורשת ישראל
תום קליפר:            גיוס בני הישיבות
זיו שלו:                   ואהבת את רעך כמוך מיהו רעך
מירב גולני:              חילול שבת עבור הצלת חיי גויי
 
 
3.      עבדות גמר בהיקף של 5 יח"ל שהוגשו למשרד החינוך:
 
נוי שמש:            עבדות ביוון ישראל ורומא            – זכתה ב"פרס שז"ר"
דולב אדר:          המלחמה בהגות היהודית   – זכתה ב"פרס גור-אריה"
עדי אורבך:        הומוסקסואליות ויהדות  -  זכתה  ב"פרס גור-אריה"
סיגל גרזון:         הבטים הלכתיים של פרשת רון ארד – זכתה בציון 95  ממשרד החינוך
 
 
 
\עדי אורבך, מסבירה את דרכי העבודה בכתיבת עבודת גמר בהיקף של 5 יח"ל בנושא "הומוסקסואליות ויהדות", תשס"ט.
http://www.youtube.com/watch?v=t_6NdvFXF2E
 
תלמידי מחשבת ישראל מציגים את עבודת החקר בנושא "מדינת ישראל – מדינה יהודית ודמוקרטית" תש"ע.
http://www.youtube.com/watch?v=K-M2ns6asbg