האגף לחינוך והדרכה בפנימיות, במינהל לחינוך התיישבותי ועליית הנוער מפעיל דגם ייחודי של מעטפת מקצועית. דגם זה משלב בין פיקוח על הפנימייה לתפקידי הנחיה והדרכה מקצועית ופיקוח על השירותים המתחייבים מהצרכים המיוחדים של בני הנוער הנקלטים בפנימיות, בסביבה משתנה ודינמית.לצורך זה מקיים האגף מגוון שירותים  .אתרי הפיקוח הפנימייתי:

היחידה לאומנויות הנחלת הלשון חינוך ופיקוח פנימייתי מדריכות- חיילות מטבחים ותזונה מנהלי פנימיות מרכזיה חינוכית מדריכי מורים פולין-ענף ירוק תזונה