המינהל אחראי על בתי-ספר אזוריים שש שנתיים בישובים הכפריים ומוסדות חינוך פנימייתיים ברחבי הארץ. הוא נותן שירות מקצועי למסגרות החינוכייות הללו תוך רגישות  לצורכיהם המיוחדים, לתפיסותיהם ודרך עבודתם השונה באמצעות האגפים והמחלקות השונות .

ביטחון בנא"מ טפסים וחוזרים חשבות יחידת המחשב מדריכי מורים לישכת מנהל המינהל משאבי אנוש פסיכוסוציאלי ורפואי קליטה לפנימיות תקציבים